原文:得分矩阵PAM与BLOSUM的比较与区别

对于蛋白质序列,计分矩阵主要用于记录在做序列比对时两个相对应的残基的相似度,一旦这个矩阵定义好了以后,比对程式就可以利用这个矩阵,尽量将相似的残基排在一起,以达到最好的比对。 得分矩阵主要有两种,第一种就是PAM Point Accepted Multation ,另一种就是BLOSUM。 PAM矩阵 Point Accepted Mutation 基于进化的点突变模型,如果两种氨基酸替换频繁,说 ...

2013-12-29 18:44 0 2779 推荐指数:

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比较 "" , '' ,`` 的区别

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Thu Feb 24 22:46:00 CST 2022 0 1392
PAM详解(二)PAM开发

摘自: http://blog.chinaunix.net/uid-29479952-id-5761564.html 目录 第二部分 PAM开发... 7 一、Pam应用程序开发... 7 1.1 pam_start() 7 1.2 pam ...

Wed Mar 11 18:10:00 CST 2020 0 1353
PAM详解(一)PAM介绍

摘自: http://blog.chinaunix.net/uid-29479952-id-5761558.html 目录 一、Pam概述... 2 二、Pam框架... 2 三、Pam服务模块... 3 四、Pam库 ...

Wed Mar 11 18:12:00 CST 2020 0 1517
矩阵和数组的区别

数组中的元素可以是字符等矩阵中的只能是数这是二者最直观的区别。因为矩阵是一个数学概念(线性代数里的),数组是个计算机上的概念。你见过纯粹数学中有数组的概念吗?没有。因为计算机上(准确的说是信息科学中)常用到线性代数的知识,就引用了矩阵的概念。 《精通MATLAB6.5版》(张志涌编著 ...

Sun Feb 04 19:21:00 CST 2018 0 11773
矩阵和数组的区别

---恢复内容开始--- 区别: 1.数组中的元素可以是字符或字符串,而矩阵只能是数 2.数学计算的区别矩阵直接用*号相乘,而数组需用.dot() 3.array更灵活,不仅能表示1维、2维,还能表示多维数据,运算速度也更快。 4.矩阵显示时,元素间无逗号;数组显示时,元素间用逗号隔开 ...

Wed Nov 07 23:20:00 CST 2018 0 2127
矩阵与张量的区别

关于矩阵和张量的区别有些人可能不太清楚,看了这篇文章相信你会很明白了。矩阵是由括号括起的n×m(例如,3×3)个数字的网格。我们可以加上和减去相同大小的矩阵,只要大小兼容((n×m)×(m×p)= n×p),就将一个矩阵与另一个矩阵相乘,以及可以将整个矩阵乘以常数。向量是一个只有一行或一列的矩阵 ...

Fri May 01 17:27:00 CST 2020 0 639
Eigen ,MKL和 matlab 矩阵乘法速度比较

Eigen 矩阵乘法的速度 < MKL矩阵乘法的速度,MKL矩阵乘法的速度与matlab矩阵乘法的速度相差不大,但matlab GPU版本的矩阵乘法速度是CUP的两倍,在采用float数据类型时10000*10000的矩阵乘法不到1秒 ...

Sun Jan 06 23:44:00 CST 2019 4 841
 
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